南門教會週末兒童營事工始於2005年南門教會重建時，由當時主日學校長黃義惠長老及同工老師們有感於社區事工的呼召，並於同年9月成立兒童週末營。活動內容包含詩歌帶動唱、遊戲、合班聖經故事以及才藝教學，讓社區的孩子們有更多接觸教會的機會。第二年更開設了“家長成長班”，在孩子們進行活動的同時，聚集家長們進行讀書會，透過親子教養的分享交流，和家長們建立更緊密的關係，進而透過關懷傳遞耶穌的愛。近年來更邀請高年級學員在混齡小組中擔任小組長，並於活動開始前一個小時至教會參與歸納式查經及遊戲策劃等裝備課程，讓孩子們親身體驗服事。